Project: xPore ซอฟท์แวร์ที่ช่วยเปรียบเทียบตำแหน่งของลำดับเบสบนสาย RNA ของเซลล์ใด ๆ เช่น เปรียบเทียบระหว่าง RNA ของผู้ป่วยมะเร็งกับคนปกติ ว่าตำแหน่งใดบนสาย RNA ที่มีลักษณะโมเลกุลไม่เหมือนกัน โดยการใช้ข้อมูลสัญญาณไฟฟ้าที่มาจาก Nanopore sequencer ซึ่งเป็นเครื่องมือแรกและเครื่องมือชนิดเดียวในตอนนี้สามารถ sequence ลำดับเบสของสาย RNA ได้โดยตรงอย่างมีประสิทธิภาพ
ถูกพัฒนาขึ้นมาเพื่อ
1. ช่วยนักชีวสารสนเทศในการหาตำแหน่งและหาปริมาณของ RNA modification บนลำดับเบส RNA ที่ไม่เหมือนกันระหว่าง samples ใดๆ ซึ่งผลลัพธ์นี้จะช่วยเป็นสมมติฐานให้กับนักวิจัยในแลปในการทำการทดลองต่อไปว่า ตำแหน่งที่ไม่เหมือนกันนั้นจะเกี่ยวข้องกับการวินิจฉัยโรค การผลิตวัคซีนหรือยา หรือการแยกแยะประเภทของไวรัส อย่างไร
2. เซลล์มนุษย์จะมีลำดับเบสหลายล้านตำแหน่ง ดังนั้นการมีซอฟท์แวร์ที่ประมวลผลได้รวดเร็วและเชื่อถือได้ จะทำให้ประหยัดเวลาในการทดลองในแลปจากหลายวันมาเป็นไม่กี่ชั่วโมง และประหยัดในเรื่องของต้นทุนและทรัพยากรในการทำแลปในห้องทดลองได้
ในปัจจุบัน xPore เป็น Python package ที่เปิดให้ใช้ฟรี v1.0 ตั้งแต่ปี 2021 ตอนนี้ได้พัฒนาเป็น v2.1 โดยมีผู้ download ไปแล้วกว่า 27,000 ครั้ง
สามารถดูรายละเอียดได้ที่ https://github.com/GoekeLab/xpore